微生物菌劑，就是目標微生物（有益菌）經過工業化擴繁之后，加工制成的活菌制劑。農用微生物菌劑，廣泛應用于經濟作物種植、禽畜糞便腐熟、工業廢棄物處理、環境改良等場合。
一般情況下，農用微生物菌劑，應用于農業生產，具有以下主要功能和作用：
1.預防病害：改善土壤微生物菌群、抑制土壤病原菌繁殖，可有效預防作物的根腐、立枯等病害；
2.提高地力：活化土壤有機與無機養份，提高肥效率，促進作物循環、長效吸收利用，增根壯苗果實飽滿；
3.改良土壤：改善土壤團粒結構，消除板結，提高保水保肥能力，抗旱、抗逆、抗寒、抗倒伏；不間斷使用，可改善土壤微生態環境。消除土壤板結、中和酸堿度、降低土壤重金屬和鹽堿毒害；
4.增根、發苗、壯秧：有益微生物在繁殖代謝過程中，可分泌細胞分裂素、吲跺乙酸、維生素、本乙酸、赤霉素等植物生長素及氨基酸等活性物質，強力促進增根、生根，壯根、毛細根數量增加一倍以上；吸水、吸肥能力加強，莖粗、苗壯、移栽緩苗快等特點。
| 檢測項目 | 具體指標 | 檢測標準 |
| 農用微生物菌劑產品技術指標 | 有效活菌數 | 農用微生物菌劑GB 20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 |
霉菌雜數 | 農用微生物菌劑GB 20287-2006 | |
雜菌率 | 農用微生物菌劑GB 20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 | |
水分 | 農用微生物菌劑GB20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 | |
Ph值 | 農用微生物菌劑GB 20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 | |
| 農用微生物菌劑產品的無害化技術指標 | 糞大腸菌群 | 農用微生物菌劑GB 20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 |
砷 | 農用微生物菌劑GB20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 | |
鎘 | 農用微生物菌劑GB/T 20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 | |
鉛 | 農用微生物菌劑GB 20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 | |
鉻 | 農用微生物菌劑GB 20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 | |
汞 | 農用微生物菌劑GB20287-2006、復合微生物肥料NY/T 798-2004 |
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